Thèse de Spectrochimie, analyse et physicochimie organiques

présentée à

L'université Paris VI (Pierre & Marie Curie)

pour obtenir le grade de Docteur de l'Université Paris VI

par

 

Carine Baraguey

 

Peptides cycliques de Jatropha spp. Isolement, analyse structurale, synthèse et activités biologiques

 

soutenue le 5 juillet 1999

 

Marquet, A., Auvin, C., Bodenhausen, G., Nicolas, P., Verducci, J., et Bodo, B., examinateurs

 

 

Résumé

 

A partir d’extraits à l’acétate d’éthyle des latex de 4 espèces différentes de Jatropha (Euphorbiacées), 9 peptides cycliques originaux ont été isolés après plusieurs étapes de chromatographie d’exclusion stérique et chromatographie d’adsorption sur gel silice, puis ont été purifiés par CLHP semi-préparative sur phase inverse. Les structures primaires de ces peptides constitué de 7 à 9 résidus majoritairement hydrophobes ont été déterminées, après analyse de la composition en acides aminés, par spectrométrie de masse et par Résonance Magnétique Nucléaire homo- et hétéronucléaire à une et deux dimensions.

 

L’étude de la conformation en solution (DMSO-d6) de 2 des heptapeptides cycliques isolés, la pohlianine A (qui contient une proline) et la mahafacycline B (qui n’en contient pas), a été réalisée sur la base des données de la RMN. La modélisation moléculaire sous contraintes RMN a été mise en œuvre et a monté que ces peptides adoptaient chacun une conformation privilégiée en faisant intervenir un premier tour b stabilisé par une liaison hydrogène 4->1 et un second tour b stabilisé par une liaison H mixte, caractérisant ainsi le motif b-bulge qui a été décrit dans les feuillets b antiparallèles de protéines.

 

La synthèse de 4 de ces peptides a été mise en oeuvre, en phase solide pour les chevaliérines A-C et en phase homogène pour la mahafacycline B, de manière à avoir une quantité suffisante de produit pur pour la réalisation des tests biologiques.

 

Les tests d’activité antiparasitaire ont montré que la curcacycline B, la chevaliérine A et la mahafacycline B avaient un effet inhibiteurs modéré sur la croissance de Plasmodium falciparum. D’autres tests d’activité biologiques ont montré que la curcacycline B était capable de se lier à la cyclophiline B et avait pour effet d’augmenter l’activité rotamase de cette dernière.

Mots clefs : jatropha / rmn / modélisation moléculaire / bulge / synthèse / peptide / baraguey / marquet